工程项目管理系统分析是开发管理信息系统过程中最重要、也是最困难的阶段。同系统设计一同是整个MIS开发工作的核心部分，系统分析工作的好坏，在很大程度上决定了系统的成败。
1、泛普工程项目管理系统分析的目的
①在充分认识原系统的基础上，通过可行性分析、业务流程分析和数据流程分析等手段，发现问题和薄弱环节，最后完成新系统的逻辑方案设计，或称逻辑模型设计。
②逻辑方案解决“做什么” ，是系统分析的任务(即系统要完成什么样的功能，提供什么样的信息)
③物理方案解决“怎样做” ，是系统设计的任务(既系统的各项功能是如何实现的，用什么样的具体方法产生和提供信息)。
2、自定义工程项目管理系统分析的困难
(1)客户不清楚需求：a.知道要什么但说不明白;b.不知道要什么;c.不知道要什么但却指出要什么
(2)需求自身经常变动：a.喜新厌旧;b.认识加深，导致更改(一般至少3次);c.环境的变化
(3)分析人员和客户的误解：a. 业务员不懂技术，技术员不懂业务
3、工程管理系统分析的基本原则
(1)逻辑设计与物理设计分开
①设计人员过早地考虑了具体的物理细节在选择处理方法及具体硬件、软件方面花了很多时间和精力
②到了开发后期又往往发现有的内容不合适，或者根本不需要，这时推翻重来，浪费很多人力、物力，若是大系统开发，后果更为严重
(2)结构化分析的原则
以抽象和分解为手段，对系统进行自顶向下的逐层分解、逐步细分、逐步求精，从而达到易于理解的目的。
①抽象是先考虑问题的最本质属性，暂不考虑具体细节，以后再逐层添加细节，即把复杂的处理内容隐蔽起来，便于抓住主体，有利于对问题的理解。
②分解是把一个复杂问题分割成若干个较小、较易解决的问题，然后分别处理
(3)基于原系统、高于原系统原则
①要求系统分析工作既不脱离实际，凭空想象，又要对现行系统中不合理的管理体制、管理模式、思想观念、工作方法以及传统习惯等进行大胆的改革和正确的引导，从而充分发挥信息技术的能力，提高工作效率，提高管理水平。
(4)用户参与原则
①尽管系统分析员在系统分析阶段要熟悉业务，但毕尽时间有限、缺乏实践，因此在系统分析的过程中要有具有较强工作经验的业务人员参与工作
②这样使系统分析员能及时掌握用户情况，便于交流;能及时修改或补充用户需求;使用户及早熟悉系统
5、财务资金管理
通过理论研究和实际应用，实现了工程概算与合同、财务科目口径的统一的关联体系，充分体现了财务分析的特色，强化了工程概算对合同管理的指导作用，强大的分析报表齐全，方便从多角度进行数据分析。
6、 项目档案管理
存储工程项目中所需要的政策、制度、文档模板及专业的管理资料等等，并进行详细的分类管理，方便调阅和随时了解和查找项目前期相关报告和批文信息;
7、项目监察管理
用于监管管理单位对项目整体进行监督检查，全面掌握项目计划、手续办理、工程进度、资金使用等情况，把握关键环节，从事后监督为主转变为事前、事中、事后全过程监督，有效防控廉政风险并降低行政成本。